近年来,单细胞核糖核酸测序引起了科学家和资助机构的极大兴趣。它可以将组织分解成数百个独立的细胞,并分析每个细胞以确定其基因表达谱,这极大地满足了人类了解自己的好奇心。
然而,由于组织分离机制切断了单个细胞和它们在组织中的原始位置之间的联系,直到现在,人们还不能知道每个细胞在原始组织中的位置信息。在最近发表在《自然》和《细胞》等杂志上的文章中,科学家们通过采用各种方法在这一领域取得了重大突破。
的最新成果是通过空间转录组技术将现有的三种基因表达谱方法结合起来。科学家将组织切片中的核酸探针与信使核糖核酸结合起来,给细胞一个“条形码”每个补丁都有不同的条形码。当每个区域的基因被测序后,条形码成为组织中细胞原始位置的记录。这种方法的一个局限性是单细胞分析受到损害。尽管如此,该方法可以在离散位置获得基因表达谱的无偏描述。
他们创建了一个由69个国际空间站探针组成的小组,并使用新开发的算法将国际空间站筛选产生的数据与单链RNA-seq数据相结合。该算法将国际空间站检测到的每个核糖核酸分子分配给一个特定的细胞核,并将每个细胞核分配给一个特定的细胞类型最终的结果是第一个人类胚胎心脏在发育6.5到7周之间的时空细胞图。
本实验的最大意义在于它突破了人类生物学研究中样本有限的客观障碍,为实现单链RNA-seq功能最大化提供了一个框架
参考文献:
https://www . NCBI . NLM . NIH . gov/PubMed/31604266?dopt =抽象
https://science . science mag . org/content/365/6460/1401 # log in-pane