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根据中国科学院西双版纳热带植物园的官方网站,该园与华南农业大学和北京脑中心合作,收集了93个新的冠状病毒样本基因组数据(截至2月12日),这些数据来自四大洲的12个国家和全球共享的12个国家。通过对全基因组数据的分析,发现武汉华南海产品市场的新型冠状病毒是从外地进口的。
中国科学院西双版纳热带植物园官方网站截图中的
93样本包含58个单倍型。进化关系表明,单体型H13和H38是相对“古老”的单体型,它们通过中间载体(mv1,其可以是祖先单体型,或者可以来自中间宿主或“患者零”)与蝙蝠冠状病毒13相关联,并且单体型H1来自单体型H3
的研究人员表示,与华南海产品市场相关的患者样本的单倍型是H1及其衍生的单倍型H2,H8-H12,而武汉样本的单倍型H3与华南海产品市场无关。可以看出,华南海产品市场的新冠状病毒是从外地传入,然后在市场上迅速传播的。另一方面,根据患者发病时间记录和人口扩张时间,也证实了华南海产品市场不是病毒的发源地的推断。
此外,研究人员将H13和H38的病毒样本追踪到深圳(广东首例)和华盛顿州(美国首例)他们的旅行记录显示,他们于2019年12月底至2020年1月初在武汉被感染。在现有的武汉样品中未检测到H13和H38单体型
研究还显示,新皇冠病毒在2月12日之前经历了两次明显的种群扩张:一次是在2019年12月8日,这表明病毒可能在12月初甚至11月下旬开始人际传播,然后在华南海产品市场加速传播。1月6日又发生了一次人口膨胀
值得一提的是,为了细分来源,研究人员将58个单倍型分为5组,包括3个古代超传播者单倍型(H1、H3和H13)和2个新的超传播者单倍型(H56和mv2)为了确定广东病毒可能有三个来源,重庆病毒和台湾病毒有两个来源澳大利亚、法国、日本和美国有更多的样本,它们至少有两个传染源,尤其是美国,有五个传染源。特别值得关注的是H56,一种超级传播体单倍型,也是澳大利亚、法国、美国和中国台湾患者的传染源。
研究还表明,在新冠状病毒的基因组中没有重组事件。