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2年2月21日，西双版纳热带植物园、中国科学院、华南农业大学和北京脑科中心在中国十四大网站上联合发表论文。该论文收集了覆盖四大洲12个国家的93个新冠状病毒样本的基因组数据(截至2月12日)，证实了华南海产品市场不是新冠状病毒的发源地
引起了公众的注意，工作室于22日发表了一篇关于这篇论文的报告。然而，许多读者在阅读后表示怀疑:华南海鲜市场不是新皇冠病毒的发源地，是武汉吗？
为此，记者特意邀请了兰州大学的科普专家、研究员赵旭茂为大家解读本文中的相关信息。新皇冠病毒
的“公司”框架在本文中，研究团队通过对全基因组数据的分析，追踪感染源和传播途径。
什么是基因组？兰州大学研究员赵旭茂(
)说，“简单的理解就是病毒手册。通过这本手册，我们可以知道病毒是什么，它包含的信息，它的传染性，种群的扩张等等“
这次，研究小组在本文中收集的93个病毒样本包括58个单倍型
什么是单体型？
从事气候变化和疾病分析研究的赵旭茂做了一个类比:正如一个公司只有在多个不同职责的部门相互合作的情况下才能有效运作一样，病毒的特征也是由许多基因决定的，单个基因无法发挥作用。这种单体型就像一个独立的部门简而言之，单倍型是决定同一性状的基因组合。
"就像一些公司一样，它们的部门是在不同的时间设立的，拥有不同的权力。类似地，单倍型在不同的时间形成，并具有不同的传递能力”赵旭茂说道在
的论文中，单体型进化关系表明单体型H13和H38是相对“古老”的单体型，它们通过中间载体——mv1(可能是祖先单体型，也可能来自中间宿主或“病人零”)与bat冠状病毒RaTG13相关联，单体型H1来自单体型H3这是什么意思？
”换句话说，第一个单体型是mv1“根据赵旭茂的解释，新皇冠病毒就像是家族企业。H38和H13是这种病毒的第一代创始人，我们可以称之为祖父单倍型。后来H3是这种病毒的第二代领导人。我们可以称之为父系单倍型。H3是该病毒的第三代领导人，其孙辈H1来自H3。
按照正常的逻辑，祖父母的单倍型位于病毒的祖先。然而，该论文的研究团队发现，与华南海产品市场相关的患者样本的单体型是H1及其衍生的单体型H2和H8-H12，而武汉样本的单体型H3与华南海产品市场无关。
”可以看出，华南海产品市场上的新型冠状病毒是从外地传入的，并在市场外迅速传播此外，根据患者发病时间记录和人口扩张时间推断，华南海产品市场不是病毒的发源地的推断也得到了证实。研究小组在论文中说
新型冠状病毒(A，B)中58种单倍型的进化关系和地理分布格局，单倍型之间可能的进化关系(C)，以及新型冠状病毒(D)可能的传播和扩散途径圆圈a和b中的数据是样本数追踪病毒来源:找到，找到，找到爷爷
武汉现有样本，为什么没有检测到“爷爷一代”单体型？
是所谓的“知己知彼”，你不会在所有的战争中被打败。该论文的研究团队追溯了H13和H38“古代”单体型病毒样本，发现它们是来自深圳(广东第一)和华盛顿州(美国第一)的患者那么，这是否意味着深圳和美国是新皇冠病毒的发源地？
事情没那么简单。通过追踪患者的感染时间和活动轨迹，两个患者的旅行记录显示，从2019年12月底至2020年1月初，两人在武汉的活动期间均被感染
”病毒也在不断更新，因为病毒的来源不在美国，病毒分散到美国，数量很少，病毒传播缓慢，另外，在美国和深圳收集的病毒时间相对较早，所以我们可以看到祖父母的单体型。”毛解释道
在这种情况下，为什么在现有的武汉样品中没有检测到H13和H38单倍型？
论文研究小组认为，这可能是因为现有样本主要是从几家指定医院采集的，采样时间限制在2019年12月24日和2020年1月5日
“随着病毒的发展，其单体型不断增长，多样性不断丰富。”因为收集时间相对较晚，祖父母的单体型很可能已经被父母和孙辈的单体型所取代。”毛分析
有鉴于此，论文研究小组提出，如果这两种单倍型能在武汉其他医院的早期患者中检测到，将对发现病毒的来源非常有帮助。
为了能够细分来源，本文的研究人员还将58个单倍型分成五组，使用三个中央(古代超级传播者)单倍型(H1、H3和H13)和两个新的超级传播者单倍型(H56和mv2)的标准为了确定广东病毒可能有三个来源，重庆病毒和台湾病毒有两个来源其中，广东省的深圳家庭在早期通过人际传播传播。澳大利亚、法国、日本和美国有更多的样本，它们的病人至少有两个感染源，尤其是美国，有五个感染源。最令人担忧的是H56，一种超级传播体单倍型，它是澳大利亚、法国和美国以及中国台湾患者的传染源。
"来自其他国家的患者样本相对较少，大多数来自单一来源。除了从武汉输入或在武汉感染外，其中一些人可能已在广东、新加坡和其他地方感染“论文研究小组说为什么武汉
是主要的爆发点，而广东的父系单体型较早，相对较好？赵旭茂分析:首先，流入广东的病毒数量相对较少，其次，当地政府在发现病毒后采取了相对严格的措施进行处理。相比之下，武汉有大量的病毒，但只是在“城市关闭”后，才采取了更严格的措施，导致越来越多的人感染。
病毒尚未重组。
和公司一样，在“扩大”后也开始扩散，这意味着什么？随着人口的流动，他们的足迹已经开始遍布全世界。
根据新冠状病毒的基因组数据，本论文的研究团队计算出新冠状病毒经历了两次大规模扩增。1月前的人口膨胀发生在12月8日。结果表明，病毒可能在12月初甚至11月下旬开始在人与人之间传播。随后，病毒在华南海产品市场的传播速度加快。该研究还计算出二月之前的人口膨胀时间是1月6日，这可能与新年假期有关。
”需要指出的是，国家疾病预防控制中心于当天发布了二级应急响应当时的预警是一种警告，公众活动和旅行都减少了。如果当时的警告能够吸引更多的公众关注，那么在1月中下旬蔓延到全国乃至全世界的病例数量将会减少。”研究小组在论文中指出
在上述研究的基础上，研究人员进一步证实，中国其他9个省和11个国家的传染病病例基本上是直接或间接从武汉输入的。
论文研究小组还发现，在新型冠状病毒的基因组中没有发生重组事件。
“简单地说，公司的部门没有重组，这表明公司仍然是同一个公司。”如果基因组重组，将会导致新的突变，那时对抗病毒将会更加困难。赵旭茂说，尽管病毒基因组尚未重组，但病毒发生了微小变化:93个基因组中有120个核苷酸发生了突变这相当于公司的部门没有改变，领导也没有改变。以下具体部门已经更换了员工。“虽然这些调整不会影响病毒的整体运作，但病毒的微妙影响将会改变已经发生的具体变化应该与结构生物学和临床表现相比较。“
”根据基因组分析，新冠状病毒的来源不在中国南方的海产品市场。确切的来源仍需相关研究人员追踪，但根据目前的相关研究，应该仍在武汉。”毛说
资料来源:经济日报
