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专题:科学大师关注
新型冠状病毒实时疫情,
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文章:殷烨华大基因CEO
最近写了一篇关于新型冠状病毒突变的描述(详细内容:中国科研团队:新型冠状病毒发生了突变,有2种亚型),这已经被热点搜索,可能意味着新型冠状病毒发生了突变
太可怕了。它变异如此之快
新皇冠病毒突变了吗?
2年17月,广东疾控中心分析了广东和武汉的早期新冠军,几乎没有突变。
2年19日,中国科学院西双版纳热带植物园分析了93个样本,发现只有120个突变均匀分布在10个编码区。
2年25日,南方医科大学分析了38株病毒的基因序列,发现总共有117个位点突变,平均分布在整个基因组中。
3年3月3日,中国疾病预防控制中心分析了120个样本的基因序列,发现基因组中只有少数突变,总体突变程度较低。
,而耶鲁大学流行病学家内森·格鲁鲍特对《自然微生物学》发表了特别评论,指出病毒突变符合正常的流行病学规律,没有必要恐慌。
也是3月3日,中国科研小组的最新发现表明,新的冠状病毒最近产生了149个突变点,并进化出两个亚型,即L亚型和S亚型研究发现,这两种亚型在地理分布和人口比例上有很大差异。S型是相对较老的类型,而L型更具攻击性和传染性。
天啊,果然新的皇冠病毒足够狡猾,能在两个月内从一个古老的国家变异成一个更具侵略性和传染性的种族?
我们必须再次讨论病毒
病毒有多简单?这不像生活那么简单。
其他生命,即使是单细胞生物,仍然独立生活,捕捉一些光子来产生能量,寻找一些碳和氮源来复制命根子(遗传物质),穿衣服(核蛋白,保护遗传物质),盖房子(膜蛋白,细胞膜),用小胳膊和小腿移动(鞭毛等)。)但是病毒,这些似乎都是不必要的,基本上除了必须保存的命根子以外,其他的衣服房子都可以从宿主细胞中拼凑出来,不具备独立锻炼的能力,也不需要新陈代谢,唯一延续的目的就是复制命根子——这确实应该是理查德·道金斯著名的断言“自私基因”
蓝藻含有叶绿素,并能进行光合作用“自给自足”
病毒:复制,复制,然后复制
。有两种病毒(如果不算朊病毒的话),脱氧核糖核酸病毒和核糖核酸病毒。正如我们以前说过的,核糖核酸病毒只有一条链,所以它更随意...(据我所知,新的冠状病毒在体外能存活多久,我告诉你)
所以核糖核酸病毒的变异很奇怪,真的很普遍因此,除了病毒从S型突变为L型之外,S型和L型两种类型出现的另一种可能解释是病毒有多种亚型,并且存在一定的多样性。
字不多说,我们看了报纸
01篇标题
关于SARS的起源和持续进化-cov-2.
翻译:新冠状病毒的起源和持续进化
说人类的话:新的皇冠病毒似乎一直在改变...
文章链接:https://academic . oup . com/nsr/advanced-article/doi/10.1093/nsr/nwaa 036/5775463
02文章状态
|发表于1993年第3期《国家科学评论》说:这是一份官方出版物。经过同行评审,哈
03研究数据
在GISAID数据库中下载了103个新的冠状病毒基因组序列特别推荐:GISAID是一个出色的在线数据工具,用于显示急性感染事件中的病原体进化。网站参考:HTTPS。方法学
使用连锁方法分析103个新的冠状病毒基因组,识别高度连锁的多态性位点,并对病毒进行分组。
05主要发现了
(1)在103个病毒基因组中发现了149个多态性位点,但绝大多数新突变为单例突变,即仅在一个病毒中发生突变连锁分析显示参考基因组8782处的T-C同义突变和28144处的C-T非同义突变的两个突变位点高度连锁。
(2)利用两个高度连锁的位点,新的冠状病毒可分为L和S两个亚型,103种病毒中有101种来自这两个亚型就比例而言,L亚型更常见,达70%,S亚型占30%
(3)与其他冠状病毒相比,发现S型在进化上更接近蝙蝠冠状病毒,可能是祖先型,L型可能是由S型进化而来
06对硬核生物信息解释的简要回顾表明,
最初用于通过整合分析103个新释放的冠状病毒株的基因组数据来识别149个多态性位点,但是大多数突变仅发生在一个病毒株中,因此提供的信息有限。通过对149个多态位点的LD分析,作者确定了两个紧密连锁的位点,并清楚地将病毒分为两组。尽管这两个分支与进化树明显不同,但是用主成分分析法和结构分析法(K=2)的分析将更有说服力(结果可能与预期一致)
此外,进化树缺少Bootstrap值,因此最好证明拓扑结构的健壮性。尽管在进化树中,S型比L型出现得早,但由于基因组数量少,多态位置信息有限,目前没有足够的证据证明L型是在S型传播过程中进化的,还是在这种传播的早期同时出现的。至于这两种亚型在传播能力或毒性上是否不同,它们是否是天然选择的并且具有功能差异,需要更多的数据甚至功能实验来验证它们。
表示:本项目的算法仍然可靠,结论也比较明确。尽管仍有改进的余地,但它确实是经过同行评审的,经得起批评。然而,由于测序病毒株的数量有限,样本的空间和时间分布可能仍有偏差,从实用的角度来看,群体对两种病毒的易感性没有明显差异。不可能强有力地证明这两种病毒是否从一开始就进化或存在。
句:论点有点小,论点没问题,结论不一定
题外话,事实上,文章还提到,目前的数据量仍然不足,新的冠状病毒最近可能没有突变成L型和S型,但这两种类型可能在病毒爆发的早期就已经存在,而目前的隔离和医疗措施已经降低了L型的频率,这可能更有害。这一结果表明当前的群体防控是有效的。或者是媒体吸引了人们的注意力并改变了节奏...
突变是病毒生命周期的自然部分,类似于我们脸上的痘或皮肤上的斑点,其中大多数是良性的对于核糖核酸病毒来说,突变是非常容易的,它不仅能增强病毒的毒性,还能削弱病毒的毒性。然而,病毒的毒性和传播方式是由多个基因控制的,换句话说,它通常需要多个突变才能使自然界发生显著变化。然而,所有关于突变后果的陈述都需要实验和流行病学证据。我们不应该对病毒的普遍变异感到恐慌。
基因组学学科大致将变异分为“突变”和“基因重组”我总是喜欢用扑克作为例子(黑梅花广场相当于ATCG)。以下是我的扑克照片。
基因组赌博之王
比如这个杂色序列,不管是哪一个突变了,都没有效果,或者是杂色序列。
,但事实并非如此,只需进行一次变异,它就不再是最大的同花顺,而是杂色同花顺,从而大大减少能量(对于病毒来说,它可能会从致命变为温和)
重组的例子参考下面的例子,两副看似平淡无奇的牌,如果换成两张,变成两张同花,我们可以简单而又虚拟地理解蝙蝠冠状病毒和猪冠状病毒重组产生一种新的可以感染人类的冠状病毒
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