美国2019年首例新型冠状病毒病例中国武汉市一起新型冠状病毒(2019-nCoV)暴发疫情概述,疫情迅速蔓延,已在多个国家确诊病例我们报告了在美国确诊的第一例2019-nCoV感染病例,并描述了该病例的鉴定、诊断、临床病程和治疗,包括患者最初的轻度症状和发病第9天发展为肺炎。这一案例强调了地方、州和国家各级临床医生和公共卫生机构之间密切协调的重要性,以及快速发布关于突发感染患者的临床信息的必要性。2019年12月31日,中国报告了与湖北省武汉市华南海产品批发市场相关的一系列肺炎病例。图1。2020年1月19日(发病第4天)后前方和侧面胸片无胸部潜在疾病
除了有高脂血症病史之外,患者不吸烟,通常健康。体格检查:体温37.2℃,血压134/87毫米汞柱,脉率110/分钟,呼吸率16次/分钟,呼吸环境空气的病人氧饱和度96%由于肺部听诊时出现干罗音,因此进行了胸部摄影,未发现异常(见图1)快速核酸扩增试验(NAAT)显示甲型和乙型流感抗原为阴性采集鼻咽拭子,NAAT用于呼吸道病毒的病原体检测。48小时后,所有检测的病原体均报告为阴性,包括甲型和乙型流感病毒、副流感病毒、呼吸道合胞病毒、鼻病毒、腺病毒和4种可导致人类疾病的冠状病毒(HKU1、NL63、229E、OC43)。根据患者的旅行史,医生立即向相关的地方和国家卫生管理部门报告。华盛顿卫生部会见急救医生后,立即向美国疾病预防控制中心急救管理中心报告。尽管患者说他没有去过武汉海鲜市场,在中国旅行期间也没有联系过任何患者,但疾控中心的工作人员一致同意根据疾控中心目前对“需要调查者”的定义,对患者进行2019-nCov检测。图2。根据患者的发病和住院日期(2020年1月16日至2020年1月30日)列出的症状和最高体温
在住院的第2至第5天(发病的第6至第9天),患者的生命体征基本稳定,除了伴有心动过速的间歇性发热。病人仍有干咳和疲劳。在住院的第二天下午,患者出现了便溏和腹部不适。晚上再解大便;采集的粪便、上呼吸道样本、鼻咽和口咽拭子均为2019-nCoV阳性,而血清为阴性从那时起,支持性治疗主要是给病人。对患者进行对症治疗:根据发热情况给予退热药物,包括每4小时650毫克对乙酰氨基酚和每6小时600毫克布洛芬。口服600毫克愈创甘油醚可缓解持续咳嗽。住院后6天内给予约6 L生理盐水。由于患者隔离病房最初只允许使用床边设备进行样本检测,所以直到住院的第三天才开始进行全血细胞计数和血清化学检测。在住院的第3天开始进行血常规和生化检测。住院第3天和第5天(发病第7天和第9天)的实验室结果显示白细胞减少、轻度血小板减少和肌酸激酶(CK)水平升高(表1)此外,肝功能指标异常:入院第5天,谷丙转氨酶(68 U/L)、谷丙转氨酶(105 U/L)、谷草转氨酶(77 U/L)和乳酸脱氢酶(465 U/L)均升高。鉴于病人反复发热,在住院的第4天进行了血培养试验,迄今没有细菌生长。住院第3天(发病第7天)的胸部x光检查显示没有肺部浸润或其他异常(图3)然而,住院第5天(发病第9天)晚上的第二张胸片显示左下叶有肺炎迹象(图4)上述影像学检查结果与患者在住院第5天晚上开始的呼吸症状变化相一致,患者当天呼吸环境空气的氧饱和度降至90%在住院的第6天,患者被给予2 L/ min鼻导管吸氧。考虑到临床表现的突然变化和医院获得性肺炎的可能性,给予万古霉素(1750 mg,然后每8小时1 g)和头孢吡肟(每8小时1次)进行治疗。表1临床实验室结果
图3。2020年1月22日(发病第7天,住院第3天)后前方和侧面胸片平胸片显示无异常征象。< br>
在住院的第6天(发病的第10天),第4张胸片显示两个下肺的索影。胸片结果与非典型肺炎的诊断一致(图5)。肺部听诊显示有水泡根据患者的影像学检查结果、开始吸氧的治疗决定、患者的持续发热、多个样本中2019-nCoV核糖核酸的持续阳性结果,以及其他患者在与患者的影像学肺炎相同的时间内出现严重肺炎的报告,临床医生许可了一种实验性抗病毒药物。在住院的第7天晚上,患者接受了remdesivir的静脉输注,remdesivir是一种处于研发阶段的核苷酸类似物,没有明显的副作用。7日晚,降钙素原连续阴性,耐甲氧西林金黄色葡萄球菌聚合酶链反应阴性,停止万古霉素。头孢吡肟在8日被叫停。3
图4 . 2020年1月24日(发病第9天,住院第5天)后的正面胸片左肺下叶的白霜变化加重,提示可能发生肺炎。< br>10
图5。2020年1月26日正面胸片和侧面胸片(发病第10天,住院第6天)肺叶底部持续的磨玻璃样斑点表明可能是非典型肺炎。磨砂玻璃样品的变化随时间而增加。用于2019-nCoV诊断试验的临床样本是根据疾病预防控制中心指南收集的*较低的周期阈值(Ct)表示较高的病毒载量。NT表示未检测到
结果
2019-nCoV样本测试
在患者发病第4天采集的初始呼吸道样本(鼻咽拭子和口咽拭子)为2019-nCoV阳性(表2)疾病第4天的循环阈值(Ct)较低(鼻咽样本为18~20,口咽样本为21~22),因此表明尽管患者的初始症状较轻,但这些样本中的病毒载量较高。发病第7天采集的两个上呼吸道样本仍为2019-NcV阳性,鼻咽拭子样本的病毒载量仍较高(ct值,23~24)发病第7天采集的粪便样本也是2019-NcV阳性(Ct值,36~38)在两个采样日期采集的血清样本均为2019年的阴性-无血清抗体发病11日和12日采集的鼻咽和口咽样本显示病毒载量呈下降趋势。发病第12天采集的口咽样本显示2019-nCoV为阴性我们仍在等待在上述日期收集的血清样本的rRT-聚合酶链反应结果。
基因测序
口咽和鼻咽样品具有相同的全基因组序列,与其他已发表的2019-nCoV序列几乎相同在患者的病毒和2019-nCoV参考序列(NC_045512.2)之间,位于开放阅读框8中的只有3个核苷酸和1个氨基酸不同。该序列显示在GenBank(登录号MN985325)中然而,应该注意的是,这些病例是根据其肺炎诊断确诊的,因此该报告可能偏向于更严重的结果。我们的患者最初表现为轻度咳嗽和轻度间歇性发热,胸片在发病第4天未显示肺炎迹象,然后在发病第9天发展为肺炎。在2019-nCoV感染的早期临床过程中,这些轻微疾病的非特异性症状和体征在临床上可能无法与许多其他常见传染病区分开来,尤其是在冬季呼吸道病毒感染季节此外,患者在发病第9天出现肺炎,这与最近一篇论文中报告的呼吸困难延迟发作(中位时间为发病第8天)相一致新型冠状病毒特别精选
米歇尔·霍尔特休,医学博士,蔡斯·德博尔特,医学博士,斯科特·林德奎斯特,医学博士,凯西·洛菲,医学博士,约翰·威斯曼,医学博士,霍利尼·布鲁斯,医学博士,克里斯托弗·斯皮特斯,医学博士,基思·埃里克森,医学博士 华盛顿州立大学2019年ncovcase调查小组*参考文献1 .世界卫生组织.不明原因肺炎-中国,2019年。 在新选项卡中打开)。< br>2。世界卫生组织。新型冠状病毒——中国。2020年(https://www . who . int/CSR/don/12-January-2020-novel-corona virus-China/en/。)3。陈JF,袁世文,郝克华,等。一个与2019年新型冠状病毒相关的家族性肺炎群表明人与人之间的传播:一项对一个家族的研究。柳叶刀2020年1月24日(Epub提前出版)。4。黄春,王勇,李霞,等。武汉地区2019年新型冠状病毒感染患者的临床特征。《柳叶刀》2020年1月24日(出版前刊)。疾病控制和预防中心。2019年新型冠状病毒,武汉,中国:2019年-无环鸟粪污染情况总结。2020年1月28日(https://www . CDC . gov/corona virus/2019-NCoV/summary . html)。越南一种新型冠状病毒的输入和人与人之间的传播。英国医学杂志。CSSE约翰·霍普金斯大学。武汉冠状病毒(2019-nCoV)全球病例(https://gisanddata.maps.arcgis.com/apps/opsdashboard/索引。)8。疾病控制和预防中心。医疗保健专业人员临时指南:指导2019年受调查患者评估的标准(PUI)-NCoV。2020(https://www . CDC . gov/corona virus/2019-NCoV/clinical-criteria . html)。疾病控制和预防中心。感染控制。2019新型冠状病毒,中国武汉。2020(https://www . CDC . gov/corona virus/2019-NCoV/inflution-control . html)。一项埃博拉病毒疾病治疗的随机对照试验。英国医学杂志2019;381:2293-2303.11。雷地西韦与洛匹那韦、利托那韦和干扰素β联合治疗MERS-CoV的疗效比较。Nat Commun 202011:222-222.12。疾病控制和预防中心。2019年新型冠状病毒(2019-nCoV)从受调查患者(PUIs)收集、处理和检测临床标本的临时指南。2020年(https://www.cdc.gov/冠状病毒/2019-NCoV/指南-临床-标本. html)。疾病控制和预防中心,呼吸道病毒科,病毒性疾病科。用于检测2019年新冠状病毒的实时逆转录聚合酶链反应板。2020年(https://www.cdc.gov/coronavirus/2019-ncov/downloads/ rt-PCR-检测面板-说明,pdf)。疾病控制和预防中心,呼吸道病毒科,病毒性疾病科。2019年-新型冠状病毒(2019-nCoV)实时荧光定量逆转录聚合酶链反应板引物和探针。2020年(https://www.cdc.gov/coronavirus/ 2019-ncov/downloads/rt-PCR-panel-primer-probes . pdf)。疾病控制和预防中心。实验室信息。2019新型冠状病毒,中国武汉。2020(https://www . CDC . gov/corona virus/2019-NCoV/guide-laboratories . html)。国立卫生研究院。GenBank概述(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genbank/.)17。(https://www.gisaid.org/全球共享所有流感数据倡议主页。)18。朱恩,张德,王伟,等。一种新的肺炎患者冠状病毒,2019。英国医学杂志。美国华盛顿州卫生部。2020年新型冠状病毒爆发(https://www.doh.wa.gov/紧急事件/冠状病毒)。)20。陈恩,周明,董新杰,等。2019年武汉地区99例新型冠状病毒肺炎的流行病学和临床特征:描述性研究。《柳叶刀》2020年1月30日(印刷前出版)。12]。鼻咽和口咽拭子样本是采用合成纤维拭子采集;每个拭子被放入装有2~3 ml病毒运送培养液的单独无菌试管中。血清被采集到血清分离管中,然后依照美国CDC指南离心。尿液和粪便样本分别采集到无菌样本容器内。运送到美国CDC之前,样本在2°C~8°C保存。用于重复2019-nCoV检测的样本是在发病第11和12日采集,包括鼻咽和口咽拭子、血清、尿液和粪便样本。
2019-nCoV的诊断检测
临床样本是通过根据公开病毒序列开发的rRT-PCR检测法进行检测。与之前严重急性呼吸综合征冠状病毒(SARS-CoV)和中东呼吸综合征冠状病毒(MERS-CoV)的诊断检测法相似,2019-nCoV的诊断检测法包括3个核衣壳基因靶点和一个阳性对照靶点。关于该检测法的说明[13]及rRT-PCR引物和探针[14]的序列的信息参见关于2019-nCoV的美国CDC实验室信息网站[15]。
基因测序
2020年1月7日,中国研究人员在美国国立卫生研究院GenBank数据库[16]和“全球流感数据共享计划”(Global Initiative on Sharing All Influenza Data,GISAID)[17]数据库共享了2019-nCoV的完整基因序列;之后又发表了关于分离2019-nCoV的报告[18]。核酸是从rRT-PCR阳性样本(口咽部和鼻咽部)提取出,并在桑格和二代测序平台(Illumina和MinIon)进行了全基因组测序。序列组装采用的是5.4.6版Sequencer软件(Sanger);2.17版minimap软件(MiniON)和1.3.1版freebayes软件(MiSeq)。将完整基因组与已发布的2019-nCoV参考序列(GenBank登录号NC_045512.2)进行了比较。
表2.2019新型冠状病毒(2019-nCoV)的实时逆转录酶聚合酶链反应检测结果。*-7-[版权信息本文由NEJM医学前沿的编辑部翻译、编辑或起草。关于NEJM集团英语产品的翻译和写作,请参考英文原版。中文翻译的全文和其中包含的图表完全由美国马萨诸塞州医学协会NEJM集团授权。如需重印,请联系nejmqianyan@nejmqianyan.cn未经授权的翻译是侵权行为,版权所有者保留调查法律责任的权利。收集报告投诉报告文章
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