在1985年两伊两伊战争期间,尽管伊拉克空军得到了苏联的大力援助,但在伊朗空军的“假猫”、“幽灵”战斗机和“鹰”防空导弹三大部件面前,它仍然遭受了重大损失。当时,飞行员们几乎都出了故障。在这种情况下,伊拉克开始用从苏联进口的原装飞毛腿短程弹道导弹攻击伊朗。当然,“飞毛腿”导弹的精确度很低,它只能选择大城市作为目标。有一段时间,它在伊朗人民中引发了严重的恐慌,大量城市居民逃到了村庄。作为报复,伊朗军队还用从卡扎菲的再出口中获得的“飞毛腿”进行报复。当然,“飞毛腿”的技术指标不会因为用户的宗教派别而改变。因此,伊朗导弹的目标也是伊拉克的大城市。这是历史上的“两伊导弹对这座城市的袭击”。
伊拉克使用在苏联专家指导下改装的原始飞毛腿和侯赛因弹道导弹,而伊朗则使用朝鲜生产的改进型流星-1型飞毛腿进行反击。最终,财大气粗的伊拉克在导弹的质量和数量上都获得了优势,并使伊朗重返谈判桌,结束了历时八年的徒劳战争。两伊战争还铸造了“飞毛腿”导弹的名字。在1988年2月至4月对该市的第二轮攻击中,伊朗和伊拉克发射了532枚导弹,几乎都是“飞毛腿”导弹及其衍生物,造成数万人伤亡。从那以后,飞毛腿导弹的声望持续了两年多。
然而,伊朗和伊拉克之间的导弹攻击战争也加强了伊朗发展弹道导弹武器的决心。在东北亚“大国”的指导下,伊朗开始以每三到五年一个模型的速度快速迭代其导弹模型。然而,所有研发的基础基本上都是飞毛腿或由“大国”改装的飞毛腿。然而,为了解决战术导弹不足的问题,伊朗还将一批进口“红旗-2”防空导弹改造成地对地弹道导弹。通过一些努力,在两伊战争结束十年后,伊朗已经装备了数百枚各种类型的中短程弹道导弹。
1999年,伊朗向该组织在伊拉克的训练营发射了十多枚导弹,试图打击萨达姆·侯赛因支持的反政府伊朗民兵。2001年,出于类似原因,伊朗向伊拉克发射了77枚弹道导弹,但目标包括许多伊拉克军事基地。当时,萨达姆·侯赛因被国际制裁所困,根本无法反击。他只能在被打后骂伊朗。这也是伊朗在今天之前最后一次使用导弹袭击伊拉克的目标。