最近,湖北省疾控中心成功完成了新冠状病毒的分离和全基因组测序,获得了该病毒的全基因组序列,全长29847bp记者
了解到,有了新冠状病毒的完整基因组序列,这意味着病毒的完整“大数据”、病毒如何生长以及在传播过程中是否发生变异,都可以被动态监控。
藿香工作照片(cap)
对获得病毒全基因组序列有多重要?
检测试剂盒的开发和抗病毒药物的开发需要依赖于对病毒的全面深入的了解。一旦病毒的基因发生变化,试剂盒也需要根据基因的变异进行优化和调整。病毒的全基因组序列也可以为制药企业寻找抗病毒药物的突破靶点提供依据。
1年31日,记者来到省疾病预防控制中心。健康检查和检测研究所的工作人员在实验室里忙碌着。副局长霍希祥介绍,该所负责新冠状病毒的检测和研究,包括病例诊断、病毒追踪、全基因组测序和分析,不仅为医务人员提供治疗依据,还为抗原制备和疫苗研发做准备。记者
了解到,该实验室下设的生物安全三级(俗称P3)实验室是国家疾病预防控制体系中具有相应资质的第六个P3实验室。在2008年获得资格认证后,实验室于2009年开始对甲型H1N1流感病毒进行病毒检测和培养。从那以后,实验室还对H7N9禽流感病毒、埃博拉病毒等引起的新的和紧急的传染病进行了紧急检测和研究。
霍希祥告诉记者,今年1月初,卫生检验检测所开始参与新冠状病毒的研究工作,协助上级部门查明原因。根据要求,送来的样本在P3实验室进行了分离,并送往国家实验室进行病原体检测。最后,国家专家组认为,这一原因不明的病毒性肺炎病例的病原体最初被确定为新的冠状病毒。
进一步了解病毒后,P3实验室被指派开展病毒分离工作,核酸检测工作由研究所的几个P2实验室承担,新的冠状病毒分离和全基因组测序工作同时进行,为试剂盒的开发奠定了良好的基础。
第二战场
整整一个月,我院一直是第二战场。检查员的工作就是与病毒竞争。病毒感染的人可以通过他们的测试被追踪。自1月中旬以来,该研究所扩大了病例筛查的范围,并加强了检测。直到春节前,每天晚上都有近300份患者样本需要检测。测试结果将在第二天早上及时报告和反馈。
需要与病毒密切接触才能检测病毒。工作人员必须反复确认防护服和口罩是否正确穿戴。为了防止技术错误,至少需要三个人参与检测。目前,四个小组同时开展了检测工作。从样品登记和编号到预处理,提取病毒核酸并进行基因扩增以获得最终结果。团队成员保证一天24小时值班,在实验室旁边设置临时床位,并在办公室用餐和生活。
1年1月25日以后,为了满足防疫和控制的需要,武汉市的几家医院、市疾病预防控制中心和区疾病预防控制中心开展了新冠状病毒的核酸检测。霍希祥认为,该检测机制能更好地满足患者和防治工作的需要,为疾病的诊断和治疗提供依据。下一步,省疾控中心还将加强对该省不同地区和不同时间的病例样本的病毒分离和基因测序,以掌握新冠状病毒的病原学和基因动态。