dna的样本_DNA样本中的胰腺癌细胞分数估计

胰腺癌的特点是基质致密为了评估分子分析中共存的非癌细胞的干扰程度，研究人员开发了一种DNA甲基化标记来评估DNA样品中的癌细胞部分

名研究人员使用癌症基因组图谱数据库中22种胰腺癌组织和9种非癌组织的微阵列数据来筛选整个基因组。用

检测31例外科肿瘤标本(10例导管内乳头状黏液性肿瘤，[IPMN)，21例胰腺癌，4例正常标本和26例非肿瘤标本通过亚硫酸氢盐焦磷酸测序进行基因特异性甲基化分析通过

全基因组筛选分离的SIM1、MIR129-2、NR1I2和HOXB-AS4在胰腺癌细胞中特异性甲基化。

亚硫酸氢盐焦磷酸测序证实在22个肿瘤样品(8个IPMN和14个癌症)(71.0%)中三个基因(SIM1，MIR129-2和NR1I2)中的一个或多个被甲基化，并且在26个正常和异常样品中显示低水平的甲基化(86.7%)

因此，这三个基因一起构成胰腺癌细胞的标志之一

通过标记估计的癌细胞部分与使用KRAS突变等位基因频率估计的癌细胞部分高度相关(R = 0.79)

结论:DNA甲基化标记可用于评估DNA样品中胰腺癌细胞的比例

参考文献