导语:发现病毒的动物宿主,包括自然宿主和中间宿主,对公共健康构成严重威胁。对这种病毒的进一步研究在平时和战时都具有重要意义。< br>
在武汉发现的新冠状病毒(2019-nCoV)在武汉及其周边地区仍然猖獗。这个国家正处于扩张阶段。据2020-01-2718:00(北京时间)统计,武汉市新发冠状病毒感染疫情为:确诊病例2823例,疑似病例5794例,死亡病例81例,治愈病例58例国家卫生委员会主任马在昨天的新闻发布会上说,疫情的预防和控制目前正处于关键时期。病毒的传播似乎有所增加。专家预测,这种流行病现在已经进入了一个更加严重和复杂的时期。马还指出,对新冠状病毒的了解还很有限,传染源还没有找到,传播机制和病毒的变异还不清楚。专家认为,春节期间的一周假期是“大隔离大消毒”的最佳窗口期当务之急是控制传染源,切断传播途径,保护弱势群体。这是三大公共卫生措施,包括清洁和消毒、隔离病人、加强个人保护和研究新的治疗方法,这将在消除疫情方面发挥重要作用。此外,发现病毒的动物宿主,包括自然宿主和中间宿主,对公众健康构成严重威胁,对该病毒的进一步研究在平时和战时都具有重要意义。——2
救生艇上的自然宿主——据中国科学院武汉病毒研究所的石团队23日在bioRxiv预印平台上发表的题为“发现一种与人类近期流行有关的新型冠状病毒及其潜在的bat起源”(发现一种新的冠状病毒及其可能的蝙蝠起源)的研究结果表明,这种新的肺炎病毒(nCoV-2019)或起源于蝙蝠
发现与最近人类肺炎暴发有关的一种新的冠状病毒及其潜在的蝙蝠来源,DOI:HTTPS://DOI.org/10.1101/2020.01.22.914952·史·李政的团队在早期阶段从5名患者中获得了该病毒的全基因组,其中5名患者的基因组基本相同,并且非典-柯夫的序列一致性为79.5%还发现云南菊头蝠中存在的nCoV-2019和RaTG13冠状病毒的序列高达96%
通过比较保守的7种非结构蛋白,发现nCoV-2019属于SARSr-CoV。此外,nCoV-2019也像非典病毒一样进入细胞内——5——中国赤褐色马蹄蝠(学名菊头蝠)值得一提的是,史的团队在追踪非典病毒方面做出了重要贡献。2005年,他们在中国RU中发现了一种类似于SARS病毒的冠状病毒,并在当年的《科学》杂志上发表了研究结果。十三年后,中国科学院武汉病毒学研究所的石和崔杰在SARS冠状病毒的起源问题上取得了突破性进展。他们最终在云南昆明的一个小山洞里的蝙蝠身上发现了非典病毒的所有基因成分,完成了非典病毒基因的测序和追踪。该发现发表在病原学杂志《公共科学图书馆病原体》上。——6-石·等在《自然》杂志上披露了SARS冠状病毒可能的重组起源,指出这一发现回答了SARS病毒起源遗留下来的问题,也指出仍存在新的传染病的风险。报道援引香港大学著名微生物学家袁教授的话说:“这一发现警告我们要减少蝙蝠等野生动物栖息地的侵扰,杜绝野生动物市场的交易,这对于防止新传染病的发生至关重要。”“现在看来相当惊人事实上,就在石的团队公布研究成果的前两天,来自中国科学院上海巴斯德研究所、国家紧急防控药物工程技术研究中心、军事医学研究所以及中国科学院分子植物卓越中心合成生物学重点实验室的研究人员加入了《中国生命科学》的行列。在线发表了一篇题为“新冠状病毒在武汉东京爆发后的演变及其峰值蛋白对人类传播风险的建模”的论文。
新冠状病毒从正在进行的武汉疫情中的进化及其对人类传播风险的尖峰蛋白的建模,科学中国生命科学,https://doi.org/10.1007/s11427-020-1637-5,说新冠状病毒和非典/非典样冠状病毒的共同祖先是一种类似于寄生在果蝠上的HKU9-1冠状病毒的病毒。由于在所有种类的蝙蝠中都发现了新冠状病毒的进化邻居和外群,也推测在武汉发现的新冠状病毒的自然宿主可能是蝙蝠。
近年来,出现了许多冠状病毒跳跃导致人与人之间传播的案例
来源:北卡罗莱纳大学华尔街日报的蒂莫西·谢汉写道,近20年来,出现了许多冠状病毒跳跃导致人与人之间传播的案例,自2002年以来,致命的冠状病毒呈上升趋势。到目前为止,已经出现了三种新的冠状病毒,包括非典、MERS和现在的新肺炎病毒(nCoV-2019)
病毒外壳上的蛋白质可以将它们锁定在宿主呼吸道的细胞上蛋白质的形状取决于病毒的基因。为了感染新的宿主,病毒的基因会发生变异,从而改变其表面蛋白,使其能够锁定新物种的细胞。有更多的证据表明,自然宿主很有可能来自蝙蝠,但中间宿主动物的来源尚未确定。它会通过哪种动物跳到人类身上根据初步流行病学调查结果,武汉新冠状病毒疫情的早期确诊病例与武汉华南地区的海产品市场密切相关。调查显示以前在海鲜市场有非法出售野生动物。中国科学院院士、中国疾病预防控制中心主任高福22日表示,其来源是海鲜市场出售的野生动物。钟南山院士还在央视之前的连线中表示,根据各种流行病学调查,它来自于一种野生动物,如竹鼠和獾。然而,由于该网站已经清理,哪一个仍然是未知的。关彝在接受财新网采访时表示,华南海鲜市场已经关闭,“犯罪现场”已经消失。没有证据很难破案。追踪动物的起源是一个复杂的过程。我不能只是找到一只带有病毒的动物,然后把它归咎于罪魁祸首。它需要科学的分析,如规模和系统。据了解,中国疾病预防控制中心病毒病研究所曾于2020年1月1日上午前往华南海鲜市场,为相关商户及相关街区收集了515份环境样本。1月12日,病毒病研究所专家再次在华南海产品市场采集了70个野生动物商店的样本,并将所有样本送至病毒病研究所进行检测。从中国南方两批海产品市场共采集了585个样品。聚合酶链反应结果显示,33个样本对新的冠状病毒核酸呈阳性。阳性样品分布在市场的22个摊位和1辆垃圾车中,其中93.9%(31/33)分布在华南海鲜市场西区。根据调查,华南海鲜市场名义上是一个海鲜市场,但实际上是一个综合市场。华南海鲜市场西区有野生动物交易,尤其是西区7街和8街内靠近市场的区域,野生动物交易商店较多,该区域阳性样本相对集中,占所有阳性样本的42.4%(14/33)。总而言之,人们高度怀疑这种流行病与野生动物贸易有关。这个结果也基本验证了高福和钟南山先前的判断。但是这项研究没有确定它是哪种特定的动物。
为了预防由新冠状病毒感染引起的肺炎疫情,阻断可能的传染源和传播途径,1月26日,市场监管总局、农业和农村部以及国家林草局禁止野生动物交易活动,直至全国疫情得到缓解。——12日——就在今天,《科学》杂志在网上发布的一份时事通讯称,这种新的冠状病毒可能并不是源自中国南方的海产品市场。这一判断源于发表在《柳叶刀》上的一篇论文。本文由中国的几个研究机构联合完成,详细描述了最初入院的41名患者。研究人员表示,第一例病例于12月1日发病,据报道与华南海产品市场无关,这意味着患者与华南海产品市场没有流行病学联系。41起案件中有13起与华南海产品市场无关——13——中国武汉2019年新型冠状病毒感染者的临床特征,doi:https://doi.org/10.1016/s0140-6736(20)30183-5美国乔治敦大学传染病专家丹尼尔·露西说:“13个不相关,比例很高。”武汉卫生委员会和世界卫生组织(世卫组织)的早期报告显示,第一名患者于12月8日出现症状,“大多数”病例与1月1日关闭的海鲜市场有关。露西说,如果新的数据是准确的,第一次人类感染,如果不是更早,应该发生在11月,因为在感染和症状之间有一个潜伏期。
患者是否来自《柳叶刀》杂志关于海产品市场的论文中的数据也质疑中国提供的初始信息的准确性。在疫情爆发之初,主要官方消息来源是武汉市卫生委员会公告它在1月11日的通知中开始将41名患者确定为唯一确诊病例,这个数字一直持续到1月18日。通知没有具体说明海鲜市场是来源,但反复指出,没有人传人的证据,大多数病例与海鲜市场有关。因为武汉市卫生委员会指出,到1月10日,这41例病例已经得到临床确认,卫生官员可能知道每个患者的病史,所以“中国的武汉卫生部门一定已经意识到疫情不是来自武汉的华南海产品市场,”露西告诉《科学》杂志。如果是这样的话,这种新的冠状病毒可能在去年12月下旬在华南海产品批发市场被发现之前,已经在武汉和其他地方的人们之间悄悄地传播了。“病毒首先进入市场,然后从那里传播”露西判断道露西说,《柳叶刀》的数据不同于中国最初发布的信息。
“现在很明显,海鲜市场不是病毒的唯一来源但是说实话,我们仍然不知道病毒来自哪里。北京首都医科大学肺病专家、《柳叶刀》论文通讯的作者曹斌在给《科学思维导报》的电子邮件中写道他表示,对中国人和动物(包括其他动物市场的商贩)的血液样本进行回顾性分析,可以更清楚地揭示新冠状病毒的来源,或许还能在混乱中找到线索。在此之前,许多国内研究人员发表了许多学术文章,并提出了可能的主持人。1月22日,北京大学、广西中医药大学、宁波大学和武汉生物工程学院等部门在《医学病毒学杂志》上发表了一篇题为《新鉴定的冠状病毒的棘突糖蛋白内的同源识别可促进蛇向人的跨种传播》的在线出版物,指出蛇是人类传播的主要途径
相对同义密码子用法(RSCU) 2019-nCoV及其假定野生动物之间的比较联合研究小组将2019-nCoV偏好的密码子与潜在宿主(如刺猬、穿山甲、蝙蝠、鸡、人和蛇)偏好的密码子进行了比较,发现2019-nCoV的密码子选择与两种蛇(银环蛇和眼镜蛇)最相似因此,研究小组认为蛇是最有可能携带2019-nCoV的野生动物。但是很快这篇文章的结论就受到了国内外学者的质疑。他们在《自然在线》上发表了一篇文章,称他们提出“蝙蝠是哺乳动物,灵猫和骆驼是哺乳动物,人类也是哺乳动物。”换句话说,非典和中东呼吸综合征病毒是在哺乳动物之间传播的。但是蛇不是哺乳动物(它们是温血动物,通常被称为冷血动物)学者认为没有证据表明病毒在爆发后会感染除哺乳动物和鸟类以外的其他物种。格拉斯哥大学的戴维·罗伯特森说:“没有证据支持蛇的入侵。”"中间宿主是谜团中缺失的部分:这些人是如何被感染的?"罗伯逊说:“2019年——副动物宿主的nCoV感染不太可能需要足够长的时间来显著改变其基因组。”这个过程需要很长时间才能完成。”
圣保罗大学的自然病毒学家保罗·爱德华多·布兰登说:“他们没有证据表明蛇能被这种新的冠状病毒感染并用作宿主除了哺乳动物和鸟类,没有一致的证据证明宿主体内存在冠状病毒。上海巴斯德研究所的病毒学家崔杰说,哺乳动物是最有可能的候选者此前,2017年在中国西南部云南省的一个洞穴中的蝙蝠身上发现了与非典相关的病毒。传染性非典型肺炎和2019年-传染性非典型肺炎属于β冠状病毒在2002-03年非典爆发后,该病毒仅在哺乳动物中通过现场调查发现。《商业周刊》23日发表的一篇文章也质疑了“新冠状病毒流行病源于蛇”的结论。这就像一个人离开武汉去北京。如果他不得不中途换车,有些人甚至建议他换车去贵阳。这不是一个好的选择。他还说,RSCU分析不适合研究冠状病毒宿主。“所以作者的结论也是一个大问题国家卫生委员会高级专家组成员、中国疾病预防控制中心首席流行病学家曾光在22日晚接受媒体采访时也表示,新冠状病毒的源头“应该是哺乳动物”。"蛇是爬行动物。“在海鲜市场上有非法出售野生动物的行为,但是在一个封闭的市场上,这些人在没有进一步证据的情况下把这些动物都带走了。它们是什么动物?”曾光说利用深度学习算法预测武汉2019新型冠状病毒的宿主和传染性(DOI):https://doi.org/10.1101/2020.01.21.914044,北京大学理工学院生物医学工程教授朱怀秋上周五(24日)表示,蝙蝠和水貂是新型冠状病毒的潜在宿主,水貂可能是中间宿主。基于VHP(病毒宿主预测)方法的冠状病毒潜在宿主(植物、细菌、无脊椎动物、脊椎动物、人类)研究的
P值,该方法通过深度学习算法来预测新冠状病毒的潜在宿主结果表明,蝙蝠传染性非典型肺炎样冠状病毒和新冠状病毒的感染模式比冠状病毒感染其他脊椎动物更相似。通过比较所有宿主在脊椎动物上的病毒传播模式,发现水貂病毒的感染模式更接近新的冠状病毒。朱怀秋团队对新冠状病毒和44种病毒进化树的研究表明,新冠状病毒的所有6个基因组都极有可能感染人类预测结果显示,这种新的冠状病毒具有很强的感染人类的潜力,类似于严重急性呼吸综合征冠状病毒(非典冠状病毒)、蝙蝠非典样冠状病毒(蝙蝠非典样冠状病毒)和中东呼吸综合征冠状病毒(中东呼吸综合征冠状病毒)许多研究人员怀疑,如果没有进一步的现场和实验室工作,2019-nCoV的一个或多个动物宿主能否被识别。许多人希望在武汉市场对动物或环境资源(如网笼和容器)进行基因测试,以找到线索。疾病控制部门需要更详细的流行病学和卫生学调查和研究。由于涉及的动物种类繁多,而且现场正在清理,因此很难研究和分析调查范围。参考:1 .https://journals.plos.org/plospathogens/article? id = 10.1371/journal . ppat . 10066982。https://www.wsj.com/articles/我们知道什么武汉病毒115797161288。编辑:杨舒菲