从目前疫情来看,武汉仍有大量疑似新冠状病毒肺炎,难以诊断根据武汉市卫生委员会1月23日关于预防和控制新冠状病毒肺炎的介绍,此前,疑似病例样本“从区疾控中心转移到武汉疾控中心,武汉疾控中心转移到湖北疾控中心进行核酸检测,每天可检测200多个样本”
每天检测200多份样本,显然无法满足涌入医院的发热患者的诊断需求。由于核酸检测是新冠状病毒肺炎诊断中最关键的一步,核酸检测的效率似乎是新肺炎诊断效率的瓶颈。那么,为什么武汉新冠状病毒肺炎的核酸检测如此困难?
太长,无法查看:用于
新冠状病毒核酸检测的荧光聚合酶链反应方法需要很长时间,需要实验室、设备和人员。
将检测机制和资源分配指定为当前瓶颈
有望通过试剂盒的快速批准缓解诊断困难。
聚合酶链反应:
目前采用的新冠状病毒核酸检测方法称为荧光聚合酶链反应(荧光聚合酶链反应),这是一项具有几十年历史的成熟分子生物学技术。聚合酶链反应完全称为聚合酶链式反应(多聚酶链反应),在中文中翻译为“聚合酶链式反应”。早在1983年,塞特斯公司的穆利斯就首次提出了这个想法,并发展了1985年出现的聚合酶链反应技术。1993年,穆赫利斯因发明聚合酶链反应技术而获得诺贝尔化学奖。众所周知,生物体的遗传物质是脱氧核糖核酸和核糖核酸大多数生物体的遗传物质是双链的脱氧核糖核酸分子,而一些核糖核酸病毒的遗传物质是核糖核酸。例如,这次新的冠状病毒是核糖核酸病毒。
在人类生命周期中,细胞中的一个双链脱氧核糖核酸分子在脱氧核糖核酸聚合酶(即聚合酶链反应中的“P”)的作用下可以复制成两个相同的双链脱氧核糖核酸分子,即获得两个拷贝数。聚合酶链反应技术是模拟试管中细胞内的脱氧核糖核酸复制过程,并在多个循环中复制少量的脱氧核糖核酸分子,使最初极少量的脱氧核糖核酸分子可以获得大量的拷贝,从而可以比较和检测所获得的脱氧核糖核酸分子。
针对的是遗传物质是核糖核酸的病毒。首先提取核糖核酸,核糖核酸序列可以被酶转化成脱氧核糖核酸分子,然后得到的脱氧核糖核酸分子经过反复循环复制,即聚合酶链反应
图| pixabi
荧光聚合酶链反应技术出现于1996年。在原始技术的基础上,荧光染料或荧光探针被用来指示复制的脱氧核糖核酸的拷贝数。荧光信号由相应的软件分析,以计算样品中初始核酸分子的含量。与常规聚合酶链反应相比,荧光聚合酶链反应技术能够更准确、定量地测定生物样品中的核酸含量,已成为目前检测病毒核酸的常规方法之一。
新型冠状病毒核酸检测试剂盒通过荧光聚合酶链反应技术检测患者肺泡灌洗液、咽喉拭子、血液等样品中新型冠状病毒核酸的含量。如果核酸含量超过某个临界值(即阳性结果),则认为患者感染了新的冠状病毒。如果样品中的核酸含量低于某个临界值(即阴性结果),则认为患者未被病毒感染。
试剂盒迅速诞生
进行新冠状病毒的核酸检测,首先必须获得新冠状病毒遗传物质核糖核酸的全基因组序列信息
2020年1月7日,获得患者标本后12天,上海市公共卫生临床中心在实验室检测到一种新的冠状病毒,并获得其全基因组序列。
后,可以人工设计和合成聚合酶链反应所需的“引物”(用于启动脱氧核糖核酸复制的一小部分脱氧核糖核酸分子)和荧光探针,对患者的生物样品进行核酸检测在实验室对荧光聚合酶链反应实验条件进行优化、测试和验证后,保证了试剂盒的准确性和准确性,避免了误诊(假阳性)和漏诊(假阴性),从而获得标准化的新的冠状病毒核酸检测试剂盒用于临床诊断
据报道,已通过国家疾病预防控制中心认证的三家试剂盒制造商(惠瑞生物、芝诺生物和伯杰医疗)已迅速投产。仅芝诺生物公司就在1月16日为75000人生产了一个试剂盒。
从病原体的分离、新冠状病毒的鉴定、全基因组序列的获取、核酸检测(荧光聚合酶链反应)试剂盒的研发,到试剂盒的生产,花了不到一个月的时间,反应速度非常快
新冠状病毒电子显微镜照片|中国疾病预防控制中心
然而,与一些常规临床试验(如血常规只有半小时)相比,荧光聚合酶链反应试验需要更长的时间。
病毒核酸应从生物样品(肺泡灌洗液、咽喉拭子、血液等)中提取。)在进行荧光聚合酶链反应测试之前通常,核酸提取器所需的时间为半小时至2小时,一次提取的样品通量为32至96小时荧光聚合酶链反应测试需要在荧光聚合酶链反应仪器上进行,通常需要大约2小时。荧光聚合酶链反应仪通常一次可以检测96个样品。由于检测过程中质量控制需要阳性对照和阴性对照,荧光聚合酶链反应仪通常一次最多可检测88个样品结合试剂制备和样品加载的操作时间,一轮荧光聚合酶链反应测试需要约5小时,然后结果分析和测试报告需要时间。因此,从患者样本被送到实验室开始测试到发布测试报告大约需要8个小时。
一台聚合酶链反应仪24小时不间断运行3班,每班配备一名检测实验室技术员,每班最多可检测88份样品,24小时只能检测200多份样品。其中,也可能有一些样品的第一次测试结果不明确(阳性和阴性结果之间),需要重新检查。
每班最多88份样本|拇指
由于新冠状病毒是一种高度传染性病毒,为了防止在检测过程中发生病毒泄漏或人员感染等生物安全事件,此类病毒的核酸检测实验室还必须达到至少二级生物安全实验室的水平。同时,采用三级生物安全实验室的个人防护,操作人员还必须是经过专业培训的探测器。因此,合格实验室的数量、荧光聚合酶链反应仪器的数量和操作人员的数量是决定新冠状病毒核酸检测效率的重要因素。
但是3A医院一般都有病毒核酸检测实验室,一些第三方检测机构也有具有相应资质的病毒核酸检测实验室,所以他们也应该能够进行检测。那么诊断效率的瓶颈在哪里?
1年23日武汉市卫生委员会官方网站发布的信息提到,根据当时病例样本的检测过程,新冠状病毒核酸的检测暂时只能在湖北省疾控中心进行,但疾控中心实验设备和检测人员有限,每天可以检测的样本数量远远不能满足武汉市疑似病例诊断的需要。
官方网站信息还提到,从1月22日起,武汉已指定指定治疗医院、指定发热诊疗医院、市疾控中心等具有相应保护级别的生物安全实验室的对口援助医院开展相关样本中新冠状病毒核酸的检测如果全部投入运行,首批10家指定检测机构预计每天将检测近2000份样品。国家卫生与安全委员会发布的通知还提到,各省可以购买服务,并与合格的第三方检测机构合作进行检测。
的问题是,虽然上述三家经国家疾病预防控制中心认证的企业已经生产了大量核酸检测试剂盒,但由于时间紧迫,尚未获得国家食品药品监督管理局的上市批准。医院和第三方检测机构暂时不能自行购买检测试剂盒。目前,只能由各省市疾病预防控制中心购买并分发给指定的检测机构。武汉计划向指定的检测机构紧急发送30,000个试剂盒,迄今已分发6,000个试剂盒。
据1月25日接口新闻最新报道,7家企业开发的新型冠状病毒核酸检测试剂盒已进入国家食品药品监督管理局快速审批渠道,预计很快将获得国家食品药品监督管理局的上市批准文件。
如果过程顺利,那么疾控中心指定的有资质的医院和第三方检测机构可以购买新的冠状病毒核酸检测试剂盒进行检测,这样资源配置效率和检测效率都将大大提高,武汉新冠状病毒肺炎的诊断难度也将减轻。
作者:DNA
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