白云观的中心建筑是丘祖殿，此殿原名处顺堂，建于元太祖二十二年，建筑宏大高耸。殿内有丘处机坐像，手执如意，面容端庄。据记载，殿内原有长春真人西游图、十八宗师画像等壁画，但今已无存。丘处机的遗体在殿下面，殿内还有一瘿钵，为一古树根雕刻制成，置于一个汉白玉的石座上。钵身刻有“大清乾隆皇帝二十年奉旨重修髹拱本观”。乾隆皇帝有谕：“庙中他日有绝粮乏食之时，道众可舁此钵从正阳门入皇宫，宫中必有赐给。”