化学消毒法:这是最常用的方法。消毒药物应考虑广谱杀菌剂。
生物消毒法:这种方法常用于堆放和发酵受污染的粪便，当嗜热菌繁殖时会产生高达70℃以上的热量。病毒、细菌、寄生虫卵等病原体可在1-2个月后被杀死。然而，这种方法不适用于炭疽和肺气肿坏疽等孢子病原体引起的流行病。这种流行病的粪便应该被焚烧或深埋。
定期消毒:每年2 ~ 4次，春秋两季各至少一次牛棚里的所有器具都应该每月消毒一次。以下药物可用于牛舍和粪尿沟的地面消毒:5% ~ 10%热碱水、3%苛性钠、3% ~ 5%来苏消毒剂等。喷雾消毒，用20%生石灰乳粉刷墙壁
临时消毒:在发现牛患有结核病、布鲁氏菌病或其他流行性疾病并将其从牛只身上带走后，应对相关牛舍、用具和运动场地进行临时消毒流产布鲁氏菌病牛时，对流产品和受污染的场所和器具必须彻底消毒。病牛的粪便应在远离牛棚的地方堆积，经生物热发酵后用作肥料。产房每月消毒一次，分娩前后消毒一次。(紫苏)